Действие происходит спустя некоторое время после завершения первого сезона. Пока Ёко занята подводными исследованиями у побережья Мадагаскара, Мадока, утратившая способность активировать глаз ауры, отправляется в Камогаву. Вернувшись домой, она находит письма от своих друзей Лан и Мугинами, в которых они рассказывают о своей жизни и тепло поздравляют её с наступившим Новым годом. Проходят месяцы, и очередной учебный год подходит к концу. Мадока переводится в новый класс, и её день рождения уже близок. В это время её лучшие подруги прилетают, чтобы увидеть копию Камогавы — межгалактический туристический узел на планете Полигидрон. Вместе они исследуют странные уголки загадочного места, вспоминают прошлые приключения и обсуждают перемены, которые произошли за время расставания с привычной Землей. Камогава становится для героев не просто локацией, а символом вечности и цветком, к которому тянутся их судьбы, подталкивая к новым открытиям и важным решениям.
