Это произведение распадается на две сюжетные линии, но объединяется в одной вселенной. Первая часть рассказывает о празднике, который собирает две школы: мужскую «Ню» и женскую «Зета» — фестиваль, задуманный Чар Азнабль и Хаман Карн, чтобы отметить их объединение. Веселье сменяется бедой, когда на праздник набрасывается банда из школы «Контратака», во главе с Амуро Рэй, Джудо Ашта и Камилем, и на сцену выходят хаос и разрушение. Вторая часть переносит нас в воображаемую страну Арк, где SD Sengokuden переосмысливает образцы мобильных доспехов и костюмов, превращая их в разумных самураев в стилистике супер-деформа. События разворачиваются на фоне мира, который отчасти напоминает древнюю Японию, где духи мечей и хитрые тактики сражений переплетаются с мифами и дворцовыми интригами. Так авторы создают уникальную вариацию легендарной вселенной Гандам, объединяя меха-эпик и эпохальные сюжеты о чести, верности и битве за будущее.
