После ухода Итиро Огами в финале Sakura Taisen 3 перед командами девушек из Сил защиты Парижских цветов встал вопрос: кто возьмет на себя бразды правления и поведёт отряд вперёд? В тесном кругу подруг и напарниц кипят обсуждения: кто из них сможет достойно стать капитаном, сохранить боевой дух и сохранить гармонию внутри команды. Но спокойной смены лидера никто не ждёт — над столицей поднимается тревога, которая скрывалась веками и внезапно просыпается. Старые враги возвращаются, древние секреты выходят на свет, угрожая не только городу, но и взаимному доверию между героинями и их будущим командиром. Париж становится полем битвы не только между металлом и мечом, но и между мечтами, обязанностью и смелостью. Каждая из девушек вынуждена переосмыслить свои силы и своё место в команде: кто сможет стать лидером, кто поддержит нового капитана, и сумеют ли они вместе противостоять надвигающейся силе, которая хочет разрушить их мир и мечты о мирной защите столицы.
