Под покровом ночи таинственный маскированный самурай расправляется с пятерными жертвами в разных уголках Японии: трое в Токио, один в Осаке и последний в Киото. Все они оказались членами банды «Гэндзиботару» — шайки воров, промышляющей похищениями буддийских статуй и артефактов, а участники носили клейма, связанные с именами слуг Минамото-но Ёсицунэ. Расследование заходит в тупик: нет явного мотива и сведений о остальных членах банды, поэтому следствие остаётся без крепких зацепок. Всё меняется, когда один из храмов Киото обращается за помощью к знаменитому Когоро Мори после получения анонимного письма с загадочной головоломкой, которую якобы необходимо разгадать ради возвращения давно утраченной статуи. В это время Конан Эдогава и юный детектив Хаттори Хэйджи объединяют усилия, чтобы распутать тайну и выйти на след убийцы, а Хэйджи параллельно ищет свою возлюбленную детства. Благодаря знанию узких улочек Киото Хаттори и Конан прочесывают город и постепенно приближаются к истине, но преступник наново наносит удар — он добивает ещё одного члена «Гэндзиботару» и, после ряда неудачных покушений на Хэйджи, похищает его возлюбленную детства. Только объединив силы и раскрыв скрытые улики, Конан и Хэйджи смогут положить конец кровавому пути мстительного самурая и вернуть любовь Хэйджи.






